人工饲养金枪鱼存在诸多难度，主要体现在以下方面：
生存环境要求高：金枪鱼多生活在广阔的大洋环境，对水质、水温、盐度等要求苛刻，适宜水温在13-25℃，需清澈、高溶氧的海水，人工模拟这样的环境成本极高。
活动空间需求大：作为快速、长距离洄游的鱼类，金枪鱼游泳能力强，需要宽敞空间，一般养殖池难以满足其对活动范围的需求，狭小空间易导致其生长受阻、体质下降。
食性特殊：金枪鱼是肉食性鱼类，主要以沙丁鱼、鱿鱼等为食，人工饲养时难以提供充足且合适的天然饵料，人工配合饲料的研发也面临挑战，且大量投喂饵料易污染水质。
繁殖技术复杂：金枪鱼的繁殖习性复杂，其繁殖需要特定的环境条件和生理刺激，在人工养殖环境下，很难模拟其自然繁殖场景，且对其繁殖生理机制尚未完全掌握，导致人工繁殖成功率低。
生长速度缓慢：金枪鱼生长缓慢，从幼鱼长到可上市规格需较长时间，期间还要面临疾病、环境变化等多种风险，养殖周期长增加了成本和管理难度。